onjour,
 
je dois analyser un logiciel en suivant ces étapes avec CheckStyle:
 
1) recalibrer pour éliminer le bruit et
Identifier de vrais problèmes
2) vérifier quelle règle chaque problème viole
3) mettre en ordre les problèmes du plus important au moins important
4) proposer comment represser la situation
 
Mais je ne comprends pas comment le faire avec CheckStyle

Mmmh...
1/ Il faut configurer checkstyle pour virer les règles qui ne servent à rien (tout dépend de ce qu'est un "vrai problème" après, mais la règle qui vérifie que la ligne dépasse pas 80 caractères me semble pas pertinente par exemple)
2/ Les rapports de checkstyle l'indiquent...
3/ Ordonné selon la priorité de la règle...
 
Si c'est la mise en œuvre technique qui pose soucis, il nous manque les infos sur ce que tu utilises comme checkstyle (plugin Eclipse, Maven, ...). Et Googe + Stacj overflow devraient largement apporter la solution