Une courte explication pour commencer. Le PC a mon taf est sous windows (XP). J'y ai clandestinement installe un linux . Mais du coup il se pose plusieurs problemes :
1. Je ne peux pas acceder commodement a mes fichiers d'un systeme sous l'autre.  
2. Je suis obliger de dupliquer les repertoires contenant les donnees de mon site web ou de mon serveur FTP (de facon a ce que ceux-ci soient accessibles quelque soit l'OS en cours d'operation), et la synchronisation est difficile a automatiser.  
 
J'aimerai donc creer un dump qui serait egalement accessible (en rwx) par les deux OS, et sur lequel seraient places les fichiers "partages". Une partition fat32 semble etre le meilleur compromis en matiere d'acces, mais elle a des problemes de definition des attributs de propriete des fichiers.
 
On notera que je ne souhaite pas mettre en commun le home/mes document (ces dossiers devant rester en place pour la gestion correcte des fichiers de configurations), mais deplacer les documents de travail (des fichiers texte quoi, je fais que du LaTeX).
 
Voici les solutions que j'ai envisage (ou qui m'ont ete proposees) :
- mettre le dump sur une partoche et mettre des liens symboliques/raccourcis. Ca marche pour l'utilisation locale, mais pas par ftp (les liens symb/raccourcis ne sont pas lisibles).
- conserver les fichiers en double faire un script de synchro (mais ca ne marche que sous linux )
 
Un autre probleme est que les serveurs web que j'utilise forcent l'un comme l'autre la racine du site a etre dans un rep. specifique, c'est contournable ?

pour le dernière question, normalement oui, tu peux définir la racine de ton site web dans le conf du serveur.
 
l'écriture est possible sur du NTFS sous GNU/Linux (mais c'est pas libre) :
http://mjules.free.fr/NTFS_et_GNU_linux.htm#ecriture

J'ai pas su le trouver, je vais regarder mieux  
 

Le "pas libre" tue tout